Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms