Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RTL6Q6ICC9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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