Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYT6Q5T7P8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms