Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP170Q5SW79 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP170Q5SW79 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms