Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMER1Q5JTC6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMER1Q5JTC6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER1Q5JTC6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms