Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHSL2Q5HYW2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHSL2Q5HYW2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms