Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP28Q4G0W2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms