Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC153Q494R4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms