Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM176BQ3YBM2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms