Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSNAXIP1Q2TAA8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSNAXIP1Q2TAA8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSNAXIP1Q2TAA8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSNAXIP1Q2TAA8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSNAXIP1Q2TAA8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TSNAXIP1Q2TAA8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms