Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF4Q2M2E3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms