Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KNOP1Q1ED39 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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