Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRNQ16849 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms