Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN3Q16667 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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