Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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CTF1Q16619 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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