Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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ECM1Q16610 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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ECM1Q16610 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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ECM1Q16610 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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ECM1Q16610 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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