Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SNAPC1Q16533 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SNAPC1Q16533 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNAPC1Q16533 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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