Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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