Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZIC1Q15915 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZIC1Q15915 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms