Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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VPS72Q15906 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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VPS72Q15906 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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VPS72Q15906 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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VPS72Q15906 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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VPS72Q15906 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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VPS72Q15906 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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VPS72Q15906 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS72Q15906 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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