Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC85BQ15834 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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