Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB3Q15768 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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EFNB3Q15768 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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EFNB3Q15768 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB3Q15768 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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