Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYTH1Q15438 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYTH1Q15438 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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