Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SEC23BQ15437 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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