Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RABEP1Q15276 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms