Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms