Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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