Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC3Q15034 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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