Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAPTM4AQ15012 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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