Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms