Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHPRHQ149N8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHPRHQ149N8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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