Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIN2CQ14957 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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