Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRCAPQ14761 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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