Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
BECN1Q14457 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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