Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2H3Q13889 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2H3Q13889 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms