Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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