Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTCH1Q13635 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTCH1Q13635 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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