Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNTB2Q13425 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms