Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHAF1BQ13112 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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