Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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