Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXD4Q12950 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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