Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROQ12816 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROQ12816 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROQ12816 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROQ12816 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROQ12816 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROQ12816 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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