Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NUP160Q12769 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms