Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms