Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPOCK1Q08629 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms