Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF85Q03923 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF85Q03923 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms