Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms