Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms