Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms