Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms